La creación del CBGP tiene su origen en la percepción de una doble necesidad: continuar realizando investigación básica a un nivel competitivo, y responder a las demandas de nuevos productos, procesos y servicios relacionados con biología de plantas, procedentes de los agentes económicos.

Durante los últimos años, el conocimiento en biología de plantas ha aumentado a un ritmo sin precedentes. La causa principal ha sido el desarrollo de tecnologías novedosas que permiten el análisis global y eficiente de la estructura, información y expresión del genoma. Esas nuevas tecnologías se apoyan en los avances en la secuenciación del ADN y las proteínas, en el uso de microchips, en la automatización de muchos de los procedimientos de laboratorio y en la posibilidad de manejar grandes cantidades de información por medio de herramientas bioinformáticas.